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复旦大学医科的前身、原上海医科大学，是中国创办的第一所国立医学院校。年，原复旦大学与原上海医科大学合并后，学校把发展生命医学作为实现创建世界一流大学的重要战略。临床医学接近进入ESI前0.1%行列，初步具备冲击世界一流学科的实力。
复旦
共有11医院，医院8家，医护员工超过1.5万人，医疗业务量接近上海市总量的四分之一。
医院开业于年，设有除儿科以外的所有科室，综合实力雄厚。心脏、肝癌、肾脏医院的重点和特色，诊治水平始终处于国内领先地位。腹部外科、骨科、介入放射、麻醉科、超声诊断和中西医结合等科室以及十余个临床医疗诊治中心皆颇具特色。
医院共设39个临床医技科室，其中拥有国家级重点学科10个——神经外科、手外科、神经病学、传染病学、中西医结合临床、泌尿外科、肾病科、心血管科、影像医学和核医学、普外科；国家临床重点专科16个；上海市临床医学中心2个。医院还引进许多国际先进的医疗仪器设备，使医院医疗设备达国内领先，接近国际先进水平。
医院创建于年，是全国儿科学重点学科、国家"工程"建设单位。是最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授权点、临床医学（儿科学组）博士后流动站的单位。年2月29日，医院闵行区新院区正式投入使用，为服务病人提供了更好的医疗条件。
医院创建于年，集妇科、产科、中西医结合科、计划生育科、新生儿科、乳腺科、妇产科研究所、上海市中西医结合月经病诊疗中心、上海市女性生殖内分泌疾病诊疗中心、上海市集爱遗传与不育诊疗中心、上海市妇科临床质控中心、卫生部妇科四类内镜诊疗技术培训基地等于一身。
医院创建于年，是全国唯一一所集眼科和耳鼻喉科医疗、教学、科研为一医院。医院眼科和耳鼻喉科均是国家教育部重点学科，还是国家临床重点专科，医教研水平处于国内领先地位。医院第二医院。
医院创建于年，是国内历史悠久、享医院。设有头颈外科、乳腺外科、胸外科、腹外科、泌尿外科、妇科、化疗科、放射治疗科、中西医结合科、姑息治疗科、麻醉科、放射诊断科、医学检验科、药剂科、内窥镜科、病理科、超声诊断科、核医学科等临床及医技科室。
医院成立于年，以干部医疗保健为重点，老年医学为特色，拥有胆胰外科中心、疝与腹壁外科疾病诊治中心、泌尿外科疾病诊治中心、消化内镜中心、老年医学中心、肿瘤诊疗中心、骨质疏松防治研究中心、影像医学中心、特需医疗中心等特色医疗中心，对心脑血管病、呼吸系统疾病、消化系统疾病、泌尿系统疾病、骨质疏松症、多脏器功能衰竭及肿瘤等疾病的诊断、治疗和抢救积累了丰富的经验。
上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心是复旦医院，主要收治病毒性肝炎、妊娠肝炎、重症肝炎、肝硬化、伤寒、乙型脑炎、流行性出血热、流行性脑脊髓膜炎、化脓性及结核性脑膜炎、肠道传染病、艾滋病、破伤风、狂犬病、性病、肺结核、传染性非典型性肺炎等各种法定传染病。在重症肝炎、妊娠肝炎、中枢神经系统感染和艾滋病治疗等方面颇具特色。
